Стандартная ошибка среднего статистика

Стандартное отклонение и стандартная ошибка: в чем разница?

  • Редакция Кодкампа


читать 2 мин


В статистике студенты часто путают два термина: стандартное отклонение и стандартная ошибка .

Стандартное отклонение измеряет, насколько разбросаны значения в наборе данных.

Стандартная ошибка — это стандартное отклонение среднего значения в повторных выборках из совокупности.

Давайте рассмотрим пример, чтобы ясно проиллюстрировать эту идею.

Пример: стандартное отклонение против стандартной ошибки

Предположим, мы измеряем вес 10 разных черепах.

Для этой выборки из 10 черепах мы можем вычислить среднее значение выборки и стандартное отклонение выборки:

Предположим, что стандартное отклонение оказалось равным 8,68. Это дает нам представление о том, насколько распределен вес этих черепах.

Но предположим, что мы собираем еще одну простую случайную выборку из 10 черепах и также проводим их измерения. Более чем вероятно, что эта выборка из 10 черепах будет иметь немного другое среднее значение и стандартное отклонение, даже если они взяты из одной и той же популяции:

Теперь, если мы представим, что мы берем повторные выборки из одной и той же совокупности и записываем выборочное среднее и выборочное стандартное отклонение для каждой выборки:

Теперь представьте, что мы наносим каждое среднее значение выборки на одну и ту же строку:

Стандартное отклонение этих средних значений известно как стандартная ошибка.

Формула для фактического расчета стандартной ошибки:

Стандартная ошибка = s/ √n

куда:

  • s: стандартное отклонение выборки
  • n: размер выборки

Какой смысл использовать стандартную ошибку?

Когда мы вычисляем среднее значение данной выборки, нас на самом деле интересует не среднее значение этой конкретной выборки, а скорее среднее значение большей совокупности, из которой взята выборка.

Однако мы используем выборки, потому что для них гораздо проще собирать данные, чем для всего населения. И, конечно же, среднее значение выборки будет варьироваться от выборки к выборке, поэтому мы используем стандартную ошибку среднего значения как способ измерить, насколько точна наша оценка среднего значения.

Вы заметите из формулы для расчета стандартной ошибки, что по мере увеличения размера выборки (n) стандартная ошибка уменьшается:

Стандартная ошибка = s/ √n

Это должно иметь смысл, поскольку большие размеры выборки уменьшают изменчивость и увеличивают вероятность того, что среднее значение нашей выборки ближе к фактическому среднему значению генеральной совокупности.

Когда использовать стандартное отклонение против стандартной ошибки

Если мы просто заинтересованы в измерении того, насколько разбросаны значения в наборе данных, мы можем использовать стандартное отклонение .

Однако, если мы заинтересованы в количественной оценке неопределенности оценки среднего значения, мы можем использовать стандартную ошибку среднего значения .

В зависимости от вашего конкретного сценария и того, чего вы пытаетесь достичь, вы можете использовать либо стандартное отклонение, либо стандартную ошибку.

From Wikipedia, the free encyclopedia

For a value that is sampled with an unbiased normally distributed error, the above depicts the proportion of samples that would fall between 0, 1, 2, and 3 standard deviations above and below the actual value.

The standard error (SE)[1] of a statistic (usually an estimate of a parameter) is the standard deviation of its sampling distribution[2] or an estimate of that standard deviation. If the statistic is the sample mean, it is called the standard error of the mean (SEM).[1]

The sampling distribution of a mean is generated by repeated sampling from the same population and recording of the sample means obtained. This forms a distribution of different means, and this distribution has its own mean and variance. Mathematically, the variance of the sampling mean distribution obtained is equal to the variance of the population divided by the sample size. This is because as the sample size increases, sample means cluster more closely around the population mean.

Therefore, the relationship between the standard error of the mean and the standard deviation is such that, for a given sample size, the standard error of the mean equals the standard deviation divided by the square root of the sample size.[1] In other words, the standard error of the mean is a measure of the dispersion of sample means around the population mean.

In regression analysis, the term «standard error» refers either to the square root of the reduced chi-squared statistic or the standard error for a particular regression coefficient (as used in, say, confidence intervals).

Standard error of the sample mean[edit]

Exact value[edit]

Suppose a statistically independent sample of n observations {\displaystyle x_{1},x_{2},\ldots ,x_{n}} is taken from a statistical population with a standard deviation of \sigma . The mean value calculated from the sample, {\bar {x}}, will have an associated standard error on the mean, {\displaystyle {\sigma }_{\bar {x}}}, given by:[1]

{\displaystyle {\sigma }_{\bar {x}}={\frac {\sigma }{\sqrt {n}}}.}

Practically this tells us that when trying to estimate the value of a population mean, due to the factor 1/{\sqrt {n}}, reducing the error on the estimate by a factor of two requires acquiring four times as many observations in the sample; reducing it by a factor of ten requires a hundred times as many observations.

Estimate[edit]

The standard deviation \sigma of the population being sampled is seldom known. Therefore, the standard error of the mean is usually estimated by replacing \sigma with the sample standard deviation \sigma _{x} instead:

{\displaystyle {\sigma }_{\bar {x}}\ \approx {\frac {\sigma _{x}}{\sqrt {n}}}.}

As this is only an estimator for the true «standard error», it is common to see other notations here such as:

{\displaystyle {\widehat {\sigma }}_{\bar {x}}:={\frac {\sigma _{x}}{\sqrt {n}}}\qquad {\text{ or }}\qquad {s}_{\bar {x}}\ :={\frac {s}{\sqrt {n}}}.}

A common source of confusion occurs when failing to distinguish clearly between:

Accuracy of the estimator[edit]

When the sample size is small, using the standard deviation of the sample instead of the true standard deviation of the population will tend to systematically underestimate the population standard deviation, and therefore also the standard error. With n = 2, the underestimate is about 25%, but for n = 6, the underestimate is only 5%. Gurland and Tripathi (1971) provide a correction and equation for this effect.[3] Sokal and Rohlf (1981) give an equation of the correction factor for small samples of n < 20.[4] See unbiased estimation of standard deviation for further discussion.

Derivation[edit]

The standard error on the mean may be derived from the variance of a sum of independent random variables,[5] given the definition of variance and some simple properties thereof. If {\displaystyle x_{1},x_{2},\ldots ,x_{n}} is a sample of n independent observations from a population with mean {\bar {x}} and standard deviation \sigma , then we can define the total

{\displaystyle T=(x_{1}+x_{2}+\cdots +x_{n})}

which due to the Bienaymé formula, will have variance

{\displaystyle \operatorname {Var} (T)={\big (}\operatorname {Var} (x_{1})+\operatorname {Var} (x_{2})+\cdots +\operatorname {Var} (x_{n}){\big )}=n\sigma ^{2}.}

where we’ve approximated the standard deviations, i.e., the uncertainties, of the measurements themselves with the best value for the standard deviation of the population. The mean of these measurements {\bar {x}} is simply given by

{\displaystyle {\bar {x}}=T/n.}

The variance of the mean is then

{\displaystyle \operatorname {Var} ({\bar {x}})=\operatorname {Var} \left({\frac {T}{n}}\right)={\frac {1}{n^{2}}}\operatorname {Var} (T)={\frac {1}{n^{2}}}n\sigma ^{2}={\frac {\sigma ^{2}}{n}}.}

The standard error is, by definition, the standard deviation of {\bar {x}} which is simply the square root of the variance:

{\displaystyle \sigma _{\bar {x}}={\sqrt {\frac {\sigma ^{2}}{n}}}={\frac {\sigma }{\sqrt {n}}}.}

For correlated random variables the sample variance needs to be computed according to the Markov chain central limit theorem.

Independent and identically distributed random variables with random sample size[edit]

There are cases when a sample is taken without knowing, in advance, how many observations will be acceptable according to some criterion. In such cases, the sample size N is a random variable whose variation adds to the variation of X such that,

{\displaystyle \operatorname {Var} (T)=\operatorname {E} (N)\operatorname {Var} (X)+\operatorname {Var} (N){\big (}\operatorname {E} (X){\big )}^{2}}

[6]
which follows from the law of total variance.

If N has a Poisson distribution, then {\displaystyle \operatorname {E} (N)=\operatorname {Var} (N)} with estimator {\displaystyle n=N}. Hence the estimator of {\displaystyle \operatorname {Var} (T)} becomes {\displaystyle nS_{X}^{2}+n{\bar {X}}^{2}}, leading the following formula for standard error:

{\displaystyle \operatorname {Standard~Error} ({\bar {X}})={\sqrt {\frac {S_{X}^{2}+{\bar {X}}^{2}}{n}}}}

(since the standard deviation is the square root of the variance).

Student approximation when σ value is unknown[edit]

In many practical applications, the true value of σ is unknown. As a result, we need to use a distribution that takes into account that spread of possible σ’s.
When the true underlying distribution is known to be Gaussian, although with unknown σ, then the resulting estimated distribution follows the Student t-distribution. The standard error is the standard deviation of the Student t-distribution. T-distributions are slightly different from Gaussian, and vary depending on the size of the sample. Small samples are somewhat more likely to underestimate the population standard deviation and have a mean that differs from the true population mean, and the Student t-distribution accounts for the probability of these events with somewhat heavier tails compared to a Gaussian. To estimate the standard error of a Student t-distribution it is sufficient to use the sample standard deviation «s» instead of σ, and we could use this value to calculate confidence intervals.

Note: The Student’s probability distribution is approximated well by the Gaussian distribution when the sample size is over 100. For such samples one can use the latter distribution, which is much simpler.

Assumptions and usage[edit]

An example of how {\displaystyle \operatorname {SE} } is used is to make confidence intervals of the unknown population mean. If the sampling distribution is normally distributed, the sample mean, the standard error, and the quantiles of the normal distribution can be used to calculate confidence intervals for the true population mean. The following expressions can be used to calculate the upper and lower 95% confidence limits, where {\bar {x}} is equal to the sample mean, {\displaystyle \operatorname {SE} } is equal to the standard error for the sample mean, and 1.96 is the approximate value of the 97.5 percentile point of the normal distribution:

In particular, the standard error of a sample statistic (such as sample mean) is the actual or estimated standard deviation of the sample mean in the process by which it was generated. In other words, it is the actual or estimated standard deviation of the sampling distribution of the sample statistic. The notation for standard error can be any one of SE, SEM (for standard error of measurement or mean), or SE.

Standard errors provide simple measures of uncertainty in a value and are often used because:

  • in many cases, if the standard error of several individual quantities is known then the standard error of some function of the quantities can be easily calculated;
  • when the probability distribution of the value is known, it can be used to calculate an exact confidence interval;
  • when the probability distribution is unknown, Chebyshev’s or the Vysochanskiï–Petunin inequalities can be used to calculate a conservative confidence interval; and
  • as the sample size tends to infinity the central limit theorem guarantees that the sampling distribution of the mean is asymptotically normal.

Standard error of mean versus standard deviation[edit]

In scientific and technical literature, experimental data are often summarized either using the mean and standard deviation of the sample data or the mean with the standard error. This often leads to confusion about their interchangeability. However, the mean and standard deviation are descriptive statistics, whereas the standard error of the mean is descriptive of the random sampling process. The standard deviation of the sample data is a description of the variation in measurements, while the standard error of the mean is a probabilistic statement about how the sample size will provide a better bound on estimates of the population mean, in light of the central limit theorem.[7]

Put simply, the standard error of the sample mean is an estimate of how far the sample mean is likely to be from the population mean, whereas the standard deviation of the sample is the degree to which individuals within the sample differ from the sample mean.[8] If the population standard deviation is finite, the standard error of the mean of the sample will tend to zero with increasing sample size, because the estimate of the population mean will improve, while the standard deviation of the sample will tend to approximate the population standard deviation as the sample size increases.

Extensions[edit]

Finite population correction (FPC)[edit]

The formula given above for the standard error assumes that the population is infinite. Nonetheless, it is often used for finite populations when people are interested in measuring the process that created the existing finite population (this is called an analytic study). Though the above formula is not exactly correct when the population is finite, the difference between the finite- and infinite-population versions will be small when sampling fraction is small (e.g. a small proportion of a finite population is studied). In this case people often do not correct for the finite population, essentially treating it as an «approximately infinite» population.

If one is interested in measuring an existing finite population that will not change over time, then it is necessary to adjust for the population size (called an enumerative study). When the sampling fraction (often termed f) is large (approximately at 5% or more) in an enumerative study, the estimate of the standard error must be corrected by multiplying by a »finite population correction» (a.k.a.: FPC):[9]
[10]

{\displaystyle \operatorname {FPC} ={\sqrt {\frac {N-n}{N-1}}}}

which, for large N:

{\displaystyle \operatorname {FPC} \approx {\sqrt {1-{\frac {n}{N}}}}={\sqrt {1-f}}}

to account for the added precision gained by sampling close to a larger percentage of the population. The effect of the FPC is that the error becomes zero when the sample size n is equal to the population size N.

This happens in survey methodology when sampling without replacement. If sampling with replacement, then FPC does not come into play.

Correction for correlation in the sample[edit]

Expected error in the mean of A for a sample of n data points with sample bias coefficient ρ. The unbiased standard error plots as the ρ = 0 diagonal line with log-log slope −12.

If values of the measured quantity A are not statistically independent but have been obtained from known locations in parameter space x, an unbiased estimate of the true standard error of the mean (actually a correction on the standard deviation part) may be obtained by multiplying the calculated standard error of the sample by the factor f:

{\displaystyle f={\sqrt {\frac {1+\rho }{1-\rho }}},}

where the sample bias coefficient ρ is the widely used Prais–Winsten estimate of the autocorrelation-coefficient (a quantity between −1 and +1) for all sample point pairs. This approximate formula is for moderate to large sample sizes; the reference gives the exact formulas for any sample size, and can be applied to heavily autocorrelated time series like Wall Street stock quotes. Moreover, this formula works for positive and negative ρ alike.[11] See also unbiased estimation of standard deviation for more discussion.

See also[edit]

  • Illustration of the central limit theorem
  • Margin of error
  • Probable error
  • Standard error of the weighted mean
  • Sample mean and sample covariance
  • Standard error of the median
  • Variance
  • Variance of the mean and predicted responses

References[edit]

  1. ^ a b c d Altman, Douglas G; Bland, J Martin (2005-10-15). «Standard deviations and standard errors». BMJ: British Medical Journal. 331 (7521): 903. doi:10.1136/bmj.331.7521.903. ISSN 0959-8138. PMC 1255808. PMID 16223828.
  2. ^ Everitt, B. S. (2003). The Cambridge Dictionary of Statistics. Cambridge University Press. ISBN 978-0-521-81099-9.
  3. ^ Gurland, J; Tripathi RC (1971). «A simple approximation for unbiased estimation of the standard deviation». American Statistician. 25 (4): 30–32. doi:10.2307/2682923. JSTOR 2682923.
  4. ^ Sokal; Rohlf (1981). Biometry: Principles and Practice of Statistics in Biological Research (2nd ed.). p. 53. ISBN 978-0-7167-1254-1.
  5. ^ Hutchinson, T. P. (1993). Essentials of Statistical Methods, in 41 pages. Adelaide: Rumsby. ISBN 978-0-646-12621-0.
  6. ^ Cornell, J R; Benjamin, C A (1970). Probability, Statistics, and Decisions for Civil Engineers. NY: McGraw-Hill. pp. 178–179. ISBN 0486796094.
  7. ^ Barde, M. (2012). «What to use to express the variability of data: Standard deviation or standard error of mean?». Perspect. Clin. Res. 3 (3): 113–116. doi:10.4103/2229-3485.100662. PMC 3487226. PMID 23125963.
  8. ^ Wassertheil-Smoller, Sylvia (1995). Biostatistics and Epidemiology : A Primer for Health Professionals (Second ed.). New York: Springer. pp. 40–43. ISBN 0-387-94388-9.
  9. ^ Isserlis, L. (1918). «On the value of a mean as calculated from a sample». Journal of the Royal Statistical Society. 81 (1): 75–81. doi:10.2307/2340569. JSTOR 2340569. (Equation 1)
  10. ^ Bondy, Warren; Zlot, William (1976). «The Standard Error of the Mean and the Difference Between Means for Finite Populations». The American Statistician. 30 (2): 96–97. doi:10.1080/00031305.1976.10479149. JSTOR 2683803. (Equation 2)
  11. ^ Bence, James R. (1995). «Analysis of Short Time Series: Correcting for Autocorrelation». Ecology. 76 (2): 628–639. doi:10.2307/1941218. JSTOR 1941218.


Загрузить PDF


Загрузить PDF

Стандартной ошибкой называется величина, которая характеризует стандартное (среднеквадратическое) отклонение выборочного среднего. Другими словами, эту величину можно использовать для оценки точности выборочного среднего. Множество областей применения стандартной ошибки по умолчанию предполагают нормальное распределение. Если вам нужно рассчитать стандартную ошибку, перейдите к шагу 1.

  1. Изображение с названием Calculate Standard Error Step 1

    1

    Запомните определение среднеквадратического отклонения. Среднеквадратическое отклонение выборки – это мера рассеянности значения. Среднеквадратическое отклонение выборки обычно обозначается буквой s. Математическая формула среднеквадратического отклонения приведена выше.

  2. Изображение с названием Calculate Standard Error Step 2

    2

    Узнайте, что такое истинное среднее значение. Истинное среднее является средним группы чисел, включающим все числа всей группы – другими словами, это среднее всей группы чисел, а не выборки.

  3. Изображение с названием Calculate Standard Error Step 3

    3

    Научитесь рассчитывать среднеарифметическое значение. Среднеаримфетическое означает попросту среднее: сумму значений собранных данных, разделенную на количество значений этих данных.

  4. Изображение с названием Calculate Standard Error Step 4

    4

    Узнайте, что такое выборочное среднее. Когда среднеарифметическое значение основано на серии наблюдений, полученных в результате выборок из статистической совокупности, оно называется “выборочным средним”. Это среднее выборки чисел, которое описывает среднее значение лишь части чисел из всей группы. Его обозначают как:

  5. Изображение с названием Calculate Standard Error Step 5

    5

    Усвойте понятие нормального распределения. Нормальные распределения, которые используются чаще других распределений, являются симметричными, с единичным максимумом в центре – на среднем значении данных. Форма кривой подобна очертаниям колокола, при этом график равномерно опускается по обе стороны от среднего. Пятьдесят процентов распределения лежит слева от среднего, а другие пятьдесят процентов – справа от него. Рассеянность значений нормального распределения описывается стандартным отклонением.

  6. Изображение с названием Calculate Standard Error Step 6

    6

    Запомните основную формулу. Формула для вычисления стандартной ошибки приведена выше.

    Реклама

  1. Изображение с названием Calculate Standard Error Step 7

    1

    Рассчитайте выборочное среднее. Чтобы найти стандартную ошибку, сначала нужно определить среднеквадратическое отклонение (поскольку среднеквадратическое отклонение s входит в формулу для вычисления стандартной ошибки). Начните с нахождения средних значений. Выборочное среднее выражается как среднее арифметическое измерений x1, x2, . . . , xn. Его рассчитывают по формуле, приведенной выше.

    • Допустим, например, что вам нужно рассчитать стандартную ошибку выборочного среднего результатов измерения массы пяти монет, указанных в таблице:
      Вы сможете рассчитать выборочное среднее, подставив значения массы в формулу:
  2. Изображение с названием Calculate Standard Error Step 8

    2

    Вычтите выборочное среднее из каждого измерения и возведите полученное значение в квадрат. Как только вы получите выборочное среднее, вы можете расширить вашу таблицу, вычтя его из каждого измерения и возведя результат в квадрат.

    • Для нашего примера расширенная таблица будет иметь следующий вид:
  3. Изображение с названием Calculate Standard Error Step 9

    3

    Найдите суммарное отклонение ваших измерений от выборочного среднего. Общее отклонение – это сумма возведенных в квадрат разностей от выборочного среднего. Чтобы определить его, сложите ваши новые значения.

    • В нашем примере нужно будет выполнить следующий расчет:
      Это уравнение дает сумму квадратов отклонений измерений от выборочного среднего.
  4. Изображение с названием Calculate Standard Error Step 10

    4

    Рассчитайте среднеквадратическое отклонение ваших измерений от выборочного среднего. Как только вы будете знать суммарное отклонение, вы сможете найти среднее отклонение, разделив ответ на n -1. Обратите внимание, что n равно числу измерений.

    • В нашем примере было сделано 5 измерений, следовательно n – 1 будет равно 4. Расчет нужно вести следующим образом:
  5. Изображение с названием Calculate Standard Error Step 11

    5

    Найдите среднеквадратичное отклонение. Сейчас у вас есть все необходимые значения для того, чтобы воспользоваться формулой для нахождения среднеквадратичного отклонения s.

    • В нашем примере вы будете рассчитывать среднеквадратичное отклонение следующим образом:
      Следовательно, среднеквадратичное отклонение равно 0,0071624.

    Реклама

  1. Изображение с названием Calculate Standard Error Step 12

    1

    Чтобы вычислить стандартную ошибку, воспользуйтесь базовой формулой со среднеквадратическим отклонением.

    • В нашем примере вы сможете рассчитать стандартную ошибку следующим образом:
      Таким образом в нашем примере стандартная ошибка (среднеквадратическое отклонение выборочного среднего) составляет 0,0032031 грамма.

Советы

  • Стандартную ошибку и среднеквадратическое отклонение часто путают. Обратите внимание, что стандартная ошибка описывает среднеквадратическое отклонение выборочного распределения статистических данных, а не распределения отдельных значений
  • В научных журналах понятия стандартной ошибки и среднеквадратического отклонения несколько размыты. Для объединения двух величин используется знак ±.

Реклама

Об этой статье

Эту страницу просматривали 50 283 раза.

Была ли эта статья полезной?

Представление результатов исследования

В научных публикациях важно представление результатов исследования. Очень часто окончательный результат приводится в следующем виде: M±m, где M – среднее арифметическое, m –ошибка среднего арифметического. Например, 163,7±0,9 см.

Прежде чем разбираться в правилах представления результатов исследования, давайте точно усвоим, что же такое ошибка среднего арифметического.

Ошибка среднего арифметического

Среднее арифметическое, вычисленное на основе выборочных данных (выборочное среднее), как правило, не совпадает с генеральным средним (средним арифметическим генеральной совокупности). Экспериментально проверить это утверждение невозможно, потому что нам неизвестно генеральное среднее. Но если из одной и той же генеральной совокупности брать повторные выборки и вычислять среднее арифметическое, то окажется, что для разных выборок среднее арифметическое будет разным.

Чтобы оценить, насколько выборочное среднее арифметическое отличается от генерального среднего, вычисляется ошибка среднего арифметического или ошибка репрезентативности.

Ошибка среднего арифметического обозначается как m или  Представление результатов исследования

Ошибка среднего арифметического рассчитывается по формуле:

Представление результатов исследования

где: S — стандартное отклонение, n – объем выборки; Например, если стандартное отклонение равно S=5 см, объем выборки n=36 человек, то ошибка среднего арифметического равна: m=5/6 = 0,833.

Ошибка среднего арифметического показывает, какая ошибка в среднем допускается, если использовать вместо генерального среднего выборочное среднее.

Так как при небольшом объеме выборки истинное значение генерального среднего не может быть определено сколь угодно точно, поэтому при вычислении выборочного среднего арифметического нет смысла оставлять большое число значащих цифр.

Правила записи результатов исследования

  1. В записи ошибки среднего арифметического оставляем две значащие цифры, если первые цифры в ошибке «1» или «2».
  2. В остальных случаях в записи ошибки среднего арифметического оставляем одну значащую цифру.
  3. В записи среднего арифметического положение последней значащей цифры должно соответствовать положению первой значащей цифры в записи ошибки среднего арифметического.

Представление результатов научных исследований

В своей статье «Осторожно, статистика!», опубликованной в 1989 году В.М. Зациорский указал, какие числовые характеристики должны быть представлены в публикации, чтобы она имела научную ценность. Он писал, что исследователь «…должен назвать: 1) среднюю величину (или другой так называемый показатель положения); 2) среднее квадратическое отклонение (или другой показатель рассеяния) и 3) число испытуемых. Без них его публикация научной ценности иметь не будет “с. 52

В научных публикациях в области физической культуры и спорта очень часто окончательный результат приводится в виде:  (М±m) (табл.1).

Таблица 1 — Изменение механических свойств латеральной широкой мышцы бедра под воздействием физической нагрузки (n=34)

Эффективный модуль

упругости (Е), кПа

Эффективный модуль

вязкости (V), Па с

Этап

эксперимента

Рассл. Напряж. Рассл. Напряж.
До ФН 7,0±0,3 17,1±1,4 29,7±1,7 46±4
После ФН 7,7±0,3 18,7±1,4 30,9±2,0 53±6

Литература

  1. Высшая математика и математическая статистика: учебное пособие для вузов / Под общ. ред. Г. И. Попова. – М. Физическая культура, 2007.– 368 с.
  2. Гласс Дж., Стэнли Дж. Статистические методы в педагогике и психологии. М.: Прогресс. 1976.- 495 с.
  3. Зациорский В.М. Осторожно — статистика! // Теория и практика физической культуры, 1989.- №2.
  4. Катранов А.Г. Компьютерная обработка данных экспериментальных исследований: Учебное пособие/ А. Г. Катранов, А. В. Самсонова; СПб ГУФК им. П.Ф. Лесгафта. – СПб.: изд-во СПб ГУФК им. П.Ф. Лесгафта, 2005. – 131 с.
  5. Основы математической статистики: Учебное пособие для ин-тов физ. культ / Под ред. В.С. Иванова.– М.: Физкультура и спорт, 1990. 176 с.

Итак, мы загрузили данные, посмотрели на них, почистили — пора приступить к внимательному изучению, чего мы там насобирали. Частично мы уже сталкивались с описательными статистиками в предыдущих главах — теперь же будем разбираться подробно.

Описательные статистики (descriptive statistics1) — обобщенные статистики, количественно описывающие особенности имеющихся данных.

Описательная статистика (descriptive statistics2) — области статистики, занимающаяся обработкой статистических данных, их наглядным представлением, и собственно описанием через описательные статистики3.

Зачем нам описательные статиски? Чтобы ёмко описать имеющиеся данные и составить на основе этих описаний общее представление о них, а также обнаружить особенности, которые могут повлиять на дальнейший анализ.

Слишком много описаний, поехали к делу уже!

Меры центральной тенденции

Насколько ёмко мы хотим описать наши даннные? Ну, попробуем для начала максимально ёмко и максимально просто — одним числом. Например, самым часто встречающимся наблюдением. Как мы будем это наблюдение искать, зависит от шкалы конкретной переменной.

Шкала Мера центральная тенденции
Номинальная Мода
Порядковая Медиана
Интервальная Среднее арифметическое
Абсолютная Среднее геометрическое и др.

Мода

Мода (mode) — наиболее часто встречающееся значение данной переменной.

Тут все достаточно просто и интуитивно понятно. Пусть у нас есть следующий вектор наблюдений:

x <- c(1,3,4,6,4,2,4,3,2,4,1)

Если мы составим таблицу частот по этому вектору, то получим следующее:

## x
## 1 2 3 4 6 
## 2 2 2 4 1

Очевидно, что \(4\) всречается в векторе чаще других значений — это и есть мода.

Также очевидно, что моду невозможно посчитать на непрерывной шкале.

Почему?

Формально моду можно определить как значение переменной, при котором функция вероятности (probability mass function) принимает максимальное значение:

\[
\mathrm{mode}(X) = \max(\mathrm{PMF}(X))
\]

К сожалению, в R нет встроенной функции для расчёта моды.

Напишите функцию, которая принимает на вход вектор значений дискретной переменной, и вычисляет моду данной переменной4. Если мод у данной переменной несколько, необходимо вернуть все.

## [1] 4
mode(c(1, 2, 2, 3, 4, 4))
## [1] 2 4

Медиана

Если мы уже гуляем на просторах порядковой шкалы, то можем посчитать медиану.

Медиана (median) — это значение, которые располягается на середине сортированного5 вектора значений переменной. То есть, она делит все наблюдения переменной ровно пополам и 50% наблюдений оказывается по одну сторону от медианы, а 50% — по другую. По этой причине медиана также называется вторым квартилем распределения.

Почему нельзя посчитать медиану на номинальной шкале?

Формальное определение медианы зависит от количества значений в векторе: если есть нечётное количество значений — то это ровно середина сортированного вектора, если есть чётное количество наблюдение — то медиана определяется как (арифметическое) среднее между двумя срединными наблюдениями.

\[
\mathrm{median} = \begin{cases}
X(\frac{n+1}{2}), & \text{ if } n \text{ is odd},\\
\dfrac{X(\frac{n}{2}) + X(\frac{n}{2}+1)}{2}, & \text{ otherwise},
\end{cases}
\]

где \(X\) — вектор налюдений данной переменной, \(n\) — число наблюдений, \(X(a)\) — наблюдение с индексом \(a\) в сортированном векторе \(X\).

Для вектора x, который был создан выше, расчёт медианы выглядит так:

## [1] 3

Изи.

Среднее

А ежели мы уже на уровне интервальной шкалы, что не грех и среднее посчитать. Вот только какое?

Арифметическое

Как правило, считается среднее арифметическое (поэтому если не указано иного, мы понимает под термином «среднее» именно «арифметическое среднее»), и далее люди не заморачиваются, что в целом разумно. По сему, мы уделим основное внимание ему, а другие посмотрим лишь обзорно.

С арифметическим средним (arithmetic mean, mean, average) все знакомы ещё со школы, и считается оно предельно просто — суммируем все наблюдения и полученную сумму делим на количество наблюдений.

\[
\bar x = \dfrac{\sum_{i=1}^{n}x_i}{n},
\]

где \(\bar X\) — среднее арифметическое, \(x_i\) — наблюдение в векторе \(X\), \(n\) — количество наблюдений.

В R оно считается абсолютно элементарно:

## [1] 3.090909

Кстати, оценка генерального среднего через выборочное среднее — это один из примеров точечной оценки параметра методом моментов.

Давайте сравним для рассмотреные статистики (используем все тот же вектор x):

## [1] 4
## [1] 3
## [1] 3.090909

Как мы видим, хотя все три статистики описывают цкентральную тенденцию, тем не менее они всё же дают разные результаты. Посмотрим их взаимное положение на графике:

mean

median

mode

Что тут можно пронаблюдать?

  • Есть два распределения — более симметричное (сплошная чёрная линия) и сильно скошенное (прерывистая чёрная линия).
  • Медианы (синие линии) делят площади под графиками пополам, как и ожидалось.
  • Кроме того, у симметричного распределения медиана и среднее оченю близки, а у скошенного распределения среднее смещается в сторону массивного правого хвоста.
  • Мода же у скошенного распредления очень близка к пику распределения.

Что из этого можно заключить?

  • Близкие значения медианы и среднего — один из показателей симметричности распределения6
  • Медиана более устойчива к выбросам

Почему?

  • Если у нас квазинепрерывная7 шкала и мы можем посчитать моду, она будет близка к пику распределения

Геометрическое

Редко встречается в научных работах, но заради общего представления пусть будет.

Геометрическое среднее (geometric mean) идейно похоже на арифметическое, только наблюдения не складываются, а перемножаются. Отсюда появляется ключевое ограничение на его использование — оно может быть рассчитано только на абсолютной шкале. В психологии абсолютных шкал прям скажем небагато, поэтому, скорее всего, вы его никогда и не встретите в практике.

И всё же есть в психологии одна абсолютная шкала, широко используемая, например, в когнитивных исследованиях. Какая?

Вычисляется она следующим образом:

\[
G_{X} = \sqrt[n]{\prod_{i=1}^n x_i} = \Big(\prod_{i=1}^n x_i\Big)^{\tfrac{1}{n}}
\]

Встроенной функции для вычисления геометрического среднего в R нет, но можно поупражняться. 😊

Напишите функцию, которая принимает на вход вектор значений переменной и вычисляет геометрическое среднее. Функция должна возвращать одно число.

## [1] 2.698696

Геометрическое среднее используется при работе с экспоненциально растущими величинами (например, численность населения).

Гармоническое

Суперэкзотичный покемон.

Тут даже говорить не буду ничего говорить, просто насладитесь формулой, а если хотите больше, то можно покопаться, например, здесь.

\[
H_X = \frac{n \prod_{i=1}^n x_i}{\sum_{i=1}^n (\tfrac{1}{x} \prod_{j=1}^n x_j)} = \frac{n}{\sum_{i=1}^n \tfrac{1}{x_i}}
\]

Квадратичное

А вот это уже более полезная история. Мы с ним столкнёмся далее, правда под разными масками.

Квадратичное среднее (quadratic mean, root mean square, RMS) — это квадратный корень из среднего квадрата наблюдений. Ничего не понятно, поэтому по порядку.

  • есть наблюдение \(x_i\)
  • значит есть и его квадрат \(x_i^2\)
  • мы умеем считать обычно среднее арифметическое, но ведь \(x_i^2\) — это тоже наблюдение, просто в квадрате, так?
  • значит можем посчитать среднее арифметическое квадратов наблюдений — средний квадрат

\[
\frac{\sum_{i=1}^n x_i^2}{n}
\]

  • норм, а теперь извлечём из этого дела корень — получим то, что там надо

\[
X_{\mathrm{RMS}} = \sqrt{\frac{\sum_{i=1}^n x_i^2}{n}}
\]

Что-то оно напоминает, да?

Per se мы его вряд ли ещё когда-то увидим, но вот когда будем идеть дело с estimation theory…

Напишите функцию, которая вычисляет квадратичное среднее по данному вектору наблюдений. Функция должна принимать на вход числовой вектор и возвращать одно число.

## [1] 1.028519

Усеченное

Так, ну, тут уже попроще.

Усеченное среднее (truncated mean, trimmed mean) — это младшая сестра среднего арифметического с той только разницей, что вычисляется не по всем наблюдениям, а по усеченной с обеих сторон выборке. То есть, из всей выборке, которая у нас есть, мы выбрасываем сколько-то низких значений и сколько-то высоких. Сколько? Ну, от 5% до 25%. По умолчанию отбрасывается по 2.5% с обеих сторон.

Зачем? Чтобы сравнить с обычным средним. Если они близки, то можно ожидать, что распределение симметрично и/или в нём нет выбросов. Если они значительно различаются, то, скорее всего, требуется почистить данные или обратить внимание на форму распределения.

Межквартильное

То же самое, что и в предыдущем пункте. Почти.

Межквартильное среднее (interquartile mean, midmean, IQM) — то же, что и усеченное среднее, только считаем мы по выборке, попавшей в пределы межквартильного размаха.

Как посчитать? Вот так:

\[
X_{\mathrm{IQM}} = \frac{2}{n} \sum_{i=\frac{n}{4}+1}^{\frac{3n}{4}} x_i
\]

Напишите функцию, которая вычисляет усеченное среднее и межквартильное среднее по данному вектору наблюдений. Функция должна принимать на вход вектор наблюдений и долю наблюдений, которую необходимо отсечь от выборки, и возвращать именованный вектор, содержащий две требуемые статистики.

Взвешенное

Полезная вещь.

Часто бывает такая ситуация, что нас нужно посчитать среднее по каким-либо имеющимся параметрам, но одни параметры для нас важнее, чем другие. Например, мы хотим вычислить суммарный балл обучающегося за курс на основе ряда работ, выполненных в течение курса, однако мы понимаем, что тест из десяти вопросов с множественном выбором явно менее показателен, чем, например, аналитическое эссе или экзаментационная оценка. Что делать? Взвесить параметры!

Что значит взвесить? Умножить на некоторое число. На самом деле, любое. Пусть мы посчитали, что написать эссе в три абстрактных раза тяжелее, чем написать тест, а сдать экзамен в два раза тяжелее, чем написать эссе. Тогда мы можем присвоить баллу за тест вес \(1\), баллу за аналитическое эссе вес \(3\), а экзамену — вес \(6\). Тогда итоговая оценка за курс будет рассчитываться следующим образом:

\[
\text{final score } = 1 \cdot \text{test} + 3 \cdot \text{essay} + 6 \cdot \text{exam}
\]

Суперкласс. Однако! Весьма вероятно, что в учебном заведении принята единая система оценки для всех видов работ (ну, скажем, некая абстрактная десятибалльная система в сферическом вакууме). Получается, если и за тест, и за эссе, и за экзамен у студента по 10 баллов, то суммарный балл 100, что, кажется, больше, чем 10. Чтобы вернуться к изначальным границам баллов, нужно моделить суммарный балл на сумму весов параметров:

\[
\text{final score } = \frac{1 \cdot \text{test} + 3 \cdot \text{essay} + 6 \cdot \text{exam}}{1 + 3 + 6}
\]

Кайф! Собственно, это и есть взвешенное среднее. Коэффициенты, на которые мы умножаем значение парамернов, называются весами параметров. И в общем виде формула принимает следующий вид.

\[
\bar x = \frac{\sum_{i=1}^n w_i x_i}{\sum_{i=1}^n w_i} = \sum_{i=1}^n w_i’ x_i,
\]

где \(x_i\) — значения конкретных параметров, \(w_i\) — веса конкретных параметров, \(w_i’\) — нормированные веса параметров.

Вторая часть формулы показывается нам, что можно облегчить себе вычислительную жизнь, если заранее нормировать веса, то есть разделить каждый коэффициент на сумму коэффициентов:

\[
w_i’ = \frac{w_i}{\sum_{i=1}^n w_i}
\]

Тогда сумма коэффициентов будет равна единице. Так чаще всего и поступают, так как тогда коэффициент будет представлять долю, которую весит данный параметр в суммарной оценке. Удобно, практично, красиво.

Взвещенное среднее часто применяется именно во всякого рода ассессментах, и не только образовательных. Например, вы HR-аналитик и оцениваете персонал. Вы аналитически вычисляете веса коэффициентов (допусти, с помощью линейной регрессии), а далее на их основе высчитаете интегральный балл, по которому будете оценивать сотрудников. Это как один из индустриальных примеров.

Есть специально обученная функция, которая вычисляет взвешенное среднее:

weighted.mean(x = c(10, 8, 8), # вектор значений параметров (например, баллы за тест, эссе и экзамен)
              w = c(0.1, 0.3, 0.6)) # веса в итоговой оценке
## [1] 8.2

На этом список средних не заканчивается, но нам обозначенных выше будет более чем достаточно.

Меры разброса

Несмотря на удобство и высокую степень приятности описания всей выборки только мерой центральной тенденции, этого маловато.

Простенький пример для наглядности. Пусть у нас есть два следующих вектора:

## [1]  5 50 12  4  4  6 24
##  [1] 20 30  6  8  2 11  1 13 28 31
## [1] 15
## [1] 15

Средние по выборкам одинаковы, однако мы явно наблдаем, что вектора различны. Более того, если пристально посмотреть, то мы обнаружим, что у них разный разброс значений. Вообще-то помня о том, что неопределенность и вариация — главные характеристики статистических данных, было бы крайне неразумно пренебречь описанием этой самой вариативности. Что ж, займемся этим вопросом.

Минимум и максимум

Как можно описать разброс? Указать минимум и максимум!

Это, во-первых, справедливо, во-вторых, просто, что даже останавливаться на этом не будем. Вот соответствующие функции:

min(x1); min(x2) # да, точка с запятой в R тоже работает
## [1] 4
## [1] 1
max(x1); max(x2) # но заклинаю вас использовать её не в ущерб удобочитаемости
## [1] 50
## [1] 31

Минимум и максимум по переменных всегда полезно смотреть при исследовании данных — так можно обнаружить ошибки записи. Например, если вы психометрик и используете в вопросах опросника семибальную шкалу его высочества Ликерта (Лайкерта), а при исследовании собранных данных обнаруживаете минимум по какому-либо вопросу 0, а максимум 9 — явно что-то пошло не так. Или, допустим, вы анализируете заработную плату сотрудников организации и обнаруживаете минимум по переменной «фонд оплаты труда» ниже МРОТ — повод задуматься. Конечно, сразу выкидывать наблюдения не надо, но точно надо обратить на них внимание и изучить возможные причины появления таких значений — может сотрудник устроен на 0.1 ставки?

Очевидно, что минимум — это первый элемент отсортированного (по возрастанию) массива, а максимум — последний. А как найти минимум (или максимум) без сортировки?

Напишите функцию, которая принимает на вход массив (вектор) и возвращает минимальный (максимальный) элемент массива. Внутри функции нельзя использовать сортировку и встроенные в R функции.

min_custom(x1); min_custom(x2)
## [1] 4
## [1] 1
max_custom(x1); max_custom(x2)
## [1] 50
## [1] 31

P.S. Функции для поиска минимума и максимума будут практически идентичны, поэтому если вы напишите одну из них, тут же поймете, как её модифицировать, чтобы получить вторую.
P.P.S. Да, это задание на алгоритмы, но это единственное задание на алгоритмы в этой книге. Вот подсказка. 🙄

Размах

А если у нас есть минимум и максимум — значит можно посчитать разницу между ими. И получить такую статистику как размах (range). Добрые люди написали одноименную функцию, правда считает она не сам размах, а выводит минимум и максимум по массиву:

## [1]  4 50
## [1]  1 31

Но это не беда, потому что другие добрые люди написали более серьезные функции, чтобы облегчить нам статистическую жизнь. С ними познакомимся далее.

Дисперсия

Ну, хорошо, range() нам указал, что действительно разброс в наших векторах различный, несмотря на то, что средние в точности равны. Что нам еще надо?

Вот другой пример. Есть два таких вектора.

##  [1]  1  1  2  5  5  6  8  8 10 10
##  [1]  1  3  4  4  5  6  7  7  9 10
## [1] 5.6
## [1] 5.6
## [1]  1 10
## [1]  1 10

Вроде и средние одинаковы, и размах одинаковый. Но вектора явно различаются. Можно даже посмотреть на картинку:

par(mfrow=c(2,1)) # размещаем два графика друг по другом
hist(x3, breaks = 10)
hist(x4, breaks = 10)

par(mfrow=c(1,1)) # откатываем настройки обратно

Всё это безобразие приводит нас к мысли о том, что нам недостаточно описания «общей», «внешней» вариативности, нам надо ещё постараться как-то ухватить вариативность «внутри» ряда наблюдений. И желательно тоже в какой-нибудь одной чиселке.

Будем действовать аккуратно и пошагово. Что у нас есть сейчас? Мы умеем считать средне, которое отражает центральную тенденцию. Ок, давайте зацепимся за него и — раз это «центр» — будем считать вариативность относительного него. Каждое наблюдение в ту или иную сторону отклоняется от среднего. Ок, мы в состоянии посчитать отклонение (deviation) каждого наблюдения:

\[
d = \bar x — x_i
\]

Топчик! А что, если… посмотреть, как в среднем все наблюдения отклоняются от среднего значения? Отличная же идея! Считаем среднее отклонение!

\[
\frac{\sum_{i=1}^n(\bar x — x_i)}{n},
\]

\(n\) — количество наблюдений в выборке.

План хорош — но не без изъяна… Так как отклонения у нас происходят в обе стороны от среднего — в положительную и отрицательную — то и в сумме они дадут нам что-то около нуля. Соответственно, и среднее отклонение у нас будет где-то около нуля. Известно, что есть два путя, как победить минус — взять модуль или возвести в квадрат.

  • Модуль. Преимущество первого в том, что размерность величины разброса остается той же, что и у измеряемой переменной8.
  • Квадрат. Преимущество второго в том, что сильные отклонения будут оказывать более сильное влияние на окончательное значение статистики, в то время как для первого малые и большие отклонения равноценны.

Второй пункт на практике нам оказывается важнее, посему, мы избирем путь Мандалора, то есть возведения в квадрат.

Итак, возводим отклонения в квадрат и — о, боги — мы получили формулу дисперсии, или вариации (dispersion, variance)!

\[
\sigma^2 = \frac{\sum_{i=1}^n (\bar x — x_i)^2}{n}
\]

Так, а что мы в итоге получили? Формулу дисперсии. Какой?

Если со средними всё было легко и непринужденно, то с дисперсией нам придётся ещё поскрипеть мозгами над тем, что такое…

Степени свободы

Википедия предлагает нам следующее определение: «количество наблюдений в финальном вычислении статистики, которые могут свободно варьироваться». Лаконично, красиво, непонятно.

В собственных заплывах на просторы статистики я нашёл два подхода к тому, как можно приблизиться к пониманию концепта степеней свободы, коими здесь с вами поделюсь. Возможно, они не столько математически точны, как хотелось бы, но позволяют уловить идею. И, в прицнипе, этого достаточно, по крайней мере, до определенного момента вашего статистического бытования.

Прежде всего, необходимо вспомнить, что мы рассчитываем наши статистики на выборке, а не на всей генеральной совокупности. Этот факт и требует внесения коррективов в формулу.

Подход номер раз

Обратим внимание, что для расчёта дисперсии мы первоначально рассчитали выборочное среднее, и далее, основываясь на рассчитанном значении, рассчитываем собственно выборочную дисперсию. То есть, чтобы рассчитать требуемую статистику, мы заранее рассчитали ещё одну как бы зафиксировав нашу выборку, чтобы нам было от чего считать отклонения. И нам надо учесть этот факт в формуле дисперсии — вычесть из числа наблюдений единицу (ту самую «одну статистику», которую мы рассчитали). Таким образом, число степеней свободы будет \(n-1\).

Аналогичная идея будет при вычислении степеней свободы в дисперсионном анализе, например.

Подход номер два

Это рассуждение ближе к математическому. Мы помним, что наш вектор наблюдений — это значения некоторой случайной величины, которые в общем-то могут быть и совсем другими при последующих измерениях. А если представить, что мы знаем только среднее по выборке? Солько измерений нам надо произвести, чтобы восстановить весь ряд наших наблюдений? Если знаем среднее, значит знаем и сумму по выборке. Чтобы восстановить все наблюдения нам надо провести \(n-1\) измерение, ведь если мы знаем сумму \(n-1\) значений, то последнее мы высчитаем следующим образом: \(x_n = \bar x — \sum_{i=1}^{n-1} x_i\). Получается, что если мы знаем среднее, то можем восстановить все \(n\) наблюдений по \(n-1\). Это и есть потерянная степень свободы.

Если таки концепт степеней свободы даётся пока что сложно — не беда. Самая главная общая идея в том, что когда мы рассчитываем выборочные статистики, нам необходимо сделать некоторые дополнительные манипуляции, чтобы избежать смещения оценок. Поэтому вводится понятие степеней свободы, которые позволяют эти манипуляции осуществить.


Итак, возвращаемся к дисперсии и разбираемся, что к чему. Формула, которую мы получили, справедлива для генеральной совокупности. В числителе дроби находится сумма квадратов отклонений (сумму квадратов, sum of squares, SS). В знаменателе находится количество наблюдений. На выборке такая формула будет давать смещённую оценку дисперсии, поэтому она также называется смещённая дисперсия.

Дисперсия генеральной совокупности (смещённая дисперсия)
\[
\sigma^2_X = \mathrm{var}(X) = \frac{\sum_{i=1}^n (\bar x — x_i)^2}{n}
\]

Для того, чтобы скорректировать оценку дисперсии, необходимо разделить сумму квадратов не на количество наблюдений, а на количество степенйе свободы, которое как мы выяснили равно \(n-1\). Выборочная дисперсия имеет собственное обозначение \(s^2\).

Выборочная дисперсия (несмещённая дисперсия, исправленная дисперсия)
\[
s^2 = \frac{\sum_{i=1}^n (\bar x — x_i)^2}{n-1}
\]

Функция, которая занимается вычислением дисперсии, называется var(), так как «вариация» (variance) — это полный синоним дисперсии.

var(x3); var(x4) # вычисляется несмещённая дисперсия
## [1] 11.82222
## [1] 7.6

И — voila! — дисперсии у наших векторов действительно различны.

Функция для расчёта дисперсии у нас есть, а вот для суммы квадратов — нет. 😞

Напишите функцию, которая вычисляет сумму квадратов отклонений от среднего значения по данному вектору. Функция принимает числовой вектор и возвращает одно число.

## [1] 68.4

Векторное представление дисперсии

— А скажи мені, автор, заради чого ми так довго топталися на цій дисперсії?
— Заради майбутнього…

Вообще концепт дисперсии — ключевой во всем статистическом анализе, поэтому дисперсия будет встречаться нам так или иначе в каждой теме.

Стандартное отклонение

Есть существует \(\sigma^2\), то где-то должна быть и \(\sigma\). И согласно здравому смыслу, вычисляться она должна извлечением квадратного корня из дисперсии.

Действительно, \(\sigma\) существует и обозначает стандартное отклонение (среднее квадратичное отклонение, standart deviation) — ещё одну меру разброса. А она нам зачем?

Дисперсия прекрасна и замечательна как статистический показатель, но вот её значение достаточно трудно интерпретировать, так как её размерность — это единицы измерения переменной в квадрате. Например, ПРИМЕР. Стандартное отклонение возвращает размерность обратно.

Так как существует две дисперсии — генеральная и выборочная — то и стандартных отклонения будет существовать два:

  • стандартное отклонение генеральной совокупности

\[
\sigma_X = \sqrt{\sigma^2_X} = \sqrt{\frac{\sum_{i=1}^n (\bar x — x_i)^2}{n}} = \sqrt{\frac{\sum_{i=1}^n d_i^2}{n}},
\]

где \(d_i = \bar x — x_i\) — отклонение. Узнали? Согласны?

  • стандартное отклонение выборки

\[
s = \mathrm{sd}(X) = \sqrt{s^2} = \sqrt{\frac{\sum_{i=1}^n (\bar x — x_i)}{n-1}}
\]

Раскопайте из недр R доказательство, что стандартное отклонение вычисляется согласно представленной выше формуле.
Помните, что R — это программное обеспечение с открытым исходным кодом?

Стандартная ошибка среднего

Набираем много выборок из генеральной совокупности. Получаем распределение средних значений. Стандартное оклонение данного распределение называется стандартной ошибкой среднего (standard error of mean).

  • стандартная ошибка среднего в генеральной совокупности

\[
\sigma_X^- = \frac{\sigma_X}{\sqrt{n}}
\]

  • стандартная ошибка среднего по выборке

\[
s_X^- = \mathrm{se}(X) = \frac{s_X}{\sqrt{n}}
\]

Стандартная ошибка, во-первых, сама по себе является интервальной оценкой среднего, а кроме того, используется при вычислении доверительного интервала. ОБЪЯСНЕНИЕ

Квантили

Мы уже обсуждали квантили в теме распределений. Теперь попробуем переложить имеющиеся знания на работу с эмпирическими данными.

Как мы знаем, квантиль — это точка на шкале признака, которая не превышается с опредлённой вероятностью по данному распределению. То есть ниже квантиля 0,02 (\(x_{0,02}\)) лежит 2% наблюдений, а ниже квантиля 0,98 (\(x_{0,98}\)) лежит практически все распределение (98%).

С произвольными квантилями в практике мы практически не работаем. Рассмотрим «особенные» квантили.

Квартили

Квартили (quartiles) — это квантили, которые делят нашу выборку на четыре части (по 25%).

  • нулевой квартиль (\(Q_0\)), он же минимум, так как ниже него лежит 0% наблюдений,
  • первый квартиль (\(Q_1\)), ниже которого лежит 25% наблюдений,
  • второй квартиль (\(Q_2\)), ниже которого лежит 50% наблюдений — это есть медиана нашего распределения,
  • третий квартиль (\(Q_3\)), ниже которого лежит 75% наблюдений,
  • четвертый квартиль (\(Q_4\)), он же максимум, так как ниже него лежит 100% наблюдений.

Квартили хорошо визуализируются графиком «ящик с усами» (boxplot). По этому графику можно увидеть симметричность распределения, разброс значений переменной, сравнить вариативность нескольких переменных.

Квартили в R можно рассчитать следующим образом:

x5 <- rnorm(100, mean = 3.5, sd = 0.45)
quantile(x5) # обратите внимание на название функции :)
##       0%      25%      50%      75%     100% 
## 2.184432 3.162326 3.507951 3.804915 4.436762

С первым и третьим квартилями связана следующая полезная метрика — межквартильный размах (interquartile range). Это разность между третьим и первым квартилем:

\[
\text{IQR}(X) = Q_3(X) — Q_1(X) = x_{0,75} — x_{0,25}
\]

Есть ли в R встроенная функция, вычисляющая межквартильный размах?

Эта метрика помогает нам определить…

Нехарактерные значения (выбросы)

Вообще нехарактерные значения — это такие значения в нашем распределении, которые сильно отклоняются от среднего. Но что значит «сильно»? Глобально — что определите, то и значит. Однако есть несколько общепринятых подходов к вопросу о том, что считать сильными отклонениями.

Нехарактерными значениями можно считать те, что отклоняются

  • от первого квартиля вниз и от третьего квартиля вверх более, чем на полтора межквартильных размаха;
  • от выборочного среднего более, чем на два (или три) стандартных отклонения.

Какой подход использовать? Зависит от вас, вашей области, требуемой строгости определения выбросов, … Стандартным считается первый подход.

На графике boxplot выбросы отображаются точками.

Что делать с обнаруженными выбросами? Желательно — анализировать. Если нехарактерные значения представляют собой артефакты записи данных, то можно от них избавиться, а если, несмотря на свою «нехарактерность», они все-таки несут в себе важное содержание, придется учитывать их в анализе, хотя они и доставляют часто множество неудобств.

Напишите функцию, которая находит выбросы. Функция должна принимать на вход числовой вектор и возвращать логический вектор такой же длины, как и исходный. Каждое значение логического вектора будет ответом на вопрос, является ли выбросом соответствующее ему значение исходного вектора. Для определения выбросов воспользуйтесь первым из упомянутых подходов.

##   [1] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
##  [13] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
##  [25] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
##  [37] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
##  [49] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
##  [61] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE  TRUE FALSE FALSE FALSE
##  [73] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
##  [85] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
##  [97] FALSE FALSE FALSE FALSE  TRUE

Асимметрия

Коэффициент асимметрии (skewness) характеризует симметричность распределение относительно среднего значения. Как мы говорили ранее, коэффициент асимметрии связан c третьим центральным моментом распределения, поэтому выборочный коэффициент асимметрии также рассчитывается на его основе.

\[
\text{skew}(X) = \frac{m_3}{s^3} = \frac{\frac{1}{n} \sum_{i=1}^n (\bar x — x_i)^3}{\big(\frac{1}{n-1} \sum_{i=1}^n (\bar x — x_i)^2\big)^{3/2}},
\]

где \(\bar x\) — выборочное среднее, \(s\) — выборочное стандартное отклонение, \(m_3\) — выборочный третий центральный момент.

Коэффициент асимметрии может принимать положительные и отрицательные значения, а также быть равным нулю.

  • положительный коэффициент асимметрии (positive skew) указывает на наличие длинного правого хвоста распределения, соответственно всё распределение будет скошено влево (то есть преобладают низкие значения)
  • отрицательный коэфффициент асимметрии (negative skew) указывает на наличие длинного левого хвоста распределения, соответственно всё распределения будет скошено вправо (то есть преобладают высокие значения)
  • значения коэффициента асимметрии, близкие к нулю, говорят о симметричности распределения

Эксцесс

Коэффиент эксцесса (excess kurtosis) показывает отсроту пика распределения. Как мы говорили ранее, коэффициент эксцесса связан с четвертым центральным моментом распределения, поэтому выборочный коэффициент эксцесса также рассчитывается на его основе.

\[
\text{kurt}(X) = \frac{m_4}{s^4} — 3 = \frac{\frac{1}{n} \sum_{i=1}^n (\bar x — x_i)^4}{\big(\frac{1}{n-1} \sum_{i=1}^n (\bar x — x_i)^2\big)^2} — 3
\]

Что в формуле коэффициента эксцесса делает \(-3\)?

Коэффициент эксцесса, как и коэффициент асимметрии, может принимать положительные, отрицательные или нулевые значения.

  • нулевой коэффициент эксцесса обозначает такой же эксцесс, как у стандартного нормального распределения (то есть, «нормальный»)
  • положительный коэффициент эксцесса обозначает, что распределение имеет более острую вершину (то есть у нас очень много средних значений, но тонкие «хвосты» — мало низких и высоких значений)
  • отрицательный коэффициент эксцесса обозначает, что распределение имеет более пологую вершину (то есть у нас меньше средних значений и толстые «хвосты» — много низких и высоких значений)

Описательные статистики в R

Ну, хорошо. А считать-то как?

Можно по отдельности:

## ── Attaching packages ─────────────────────────────────────── tidyverse 1.3.0 ──
## ✓ tibble  3.0.4     ✓ dplyr   1.0.2
## ✓ tidyr   1.1.2     ✓ stringr 1.4.0
## ✓ readr   1.4.0     ✓ forcats 0.5.0
## ✓ purrr   0.3.4
## ── Conflicts ────────────────────────────────────────── tidyverse_conflicts() ──
## x dplyr::filter() masks stats::filter()
## x dplyr::lag()    masks stats::lag()
# воспользуемся данными, которые уже видели
share <- read_csv('https://raw.githubusercontent.com/angelgardt/mk_ggplot2/master/sharexp_data.csv')
## 
## ── Column specification ────────────────────────────────────────────────────────
## cols(
##   .default = col_double(),
##   trialtype = col_character(),
##   platform = col_character()
## )
## ℹ Use `spec()` for the full column specifications.
## [1] 1.599066
## [1] 1.346363
## [1] 0.7451164
## [1] 0.8632012
## [1] 0.5392201
## [1] 12.23256

Но можно и все сразу:

psych::describe(share$time1)
##    vars     n mean   sd median trimmed mad  min   max range skew kurtosis   se
## X1    1 16200  1.6 0.86   1.35    1.45 0.5 0.54 12.23 11.69 3.03    16.88 0.01

Но это мы посчитали по всей переменной времени реакции сразу. А обычно нас интересуют описательные статистики по экспериментальным группам. Это можно сделать так:

psych::describeBy(share$time1, group = share$trialtype)
## 
##  Descriptive statistics by group 
## group: both
##    vars    n mean  sd median trimmed  mad  min   max range skew kurtosis   se
## X1    1 5400 1.38 0.6   1.23    1.29 0.39 0.54 10.89 10.35 3.35    26.63 0.01
## ------------------------------------------------------------ 
## group: dots
##    vars    n mean   sd median trimmed  mad  min   max range skew kurtosis   se
## X1    1 5400 1.68 0.93    1.4    1.52 0.55 0.58 12.23 11.66 2.92    15.97 0.01
## ------------------------------------------------------------ 
## group: tray
##    vars    n mean   sd median trimmed  mad  min   max range skew kurtosis   se
## X1    1 5400 1.74 0.97   1.45    1.57 0.59 0.58 11.88  11.3 2.68    12.25 0.01
psych::describeBy(share$time1, group = interaction(share$trialtype, share$setsize))
## 
##  Descriptive statistics by group 
## group: both.8
##    vars    n mean   sd median trimmed  mad  min  max range skew kurtosis   se
## X1    1 1800 1.24 0.44   1.13    1.18 0.32 0.54 4.86  4.32 2.11     7.45 0.01
## ------------------------------------------------------------ 
## group: dots.8
##    vars    n mean   sd median trimmed  mad  min  max range skew kurtosis   se
## X1    1 1800 1.43 0.68   1.26    1.33 0.41 0.58 7.65  7.07 3.21    17.73 0.02
## ------------------------------------------------------------ 
## group: tray.8
##    vars    n mean   sd median trimmed  mad  min  max range skew kurtosis   se
## X1    1 1800 1.44 0.62   1.28    1.34 0.42 0.63 6.56  5.93 2.68    12.46 0.01
## ------------------------------------------------------------ 
## group: both.12
##    vars    n mean   sd median trimmed  mad min   max range skew kurtosis   se
## X1    1 1800 1.37 0.61   1.22    1.28 0.37 0.6 10.89 10.29 4.37    43.73 0.01
## ------------------------------------------------------------ 
## group: dots.12
##    vars    n mean   sd median trimmed  mad  min   max range skew kurtosis   se
## X1    1 1800 1.68 0.86   1.43    1.54 0.56 0.59 11.66 11.07 2.64    14.76 0.02
## ------------------------------------------------------------ 
## group: tray.12
##    vars    n mean   sd median trimmed mad min   max range skew kurtosis   se
## X1    1 1800 1.73 0.86    1.5     1.6 0.6 0.6 10.03  9.43 2.19     8.78 0.02
## ------------------------------------------------------------ 
## group: both.16
##    vars    n mean   sd median trimmed  mad  min  max range skew kurtosis   se
## X1    1 1800 1.53 0.69   1.35    1.43 0.49 0.55 9.25   8.7 2.72    16.06 0.02
## ------------------------------------------------------------ 
## group: dots.16
##    vars    n mean   sd median trimmed  mad min   max range skew kurtosis   se
## X1    1 1800 1.92 1.13   1.59    1.74 0.71 0.6 12.23 11.64 2.62    12.49 0.03
## ------------------------------------------------------------ 
## group: tray.16
##    vars    n mean   sd median trimmed  mad  min   max range skew kurtosis   se
## X1    1 1800 2.05 1.22   1.68    1.85 0.81 0.58 11.88  11.3 2.31     8.61 0.03

Но мы же с вами осваивали tidyverse не просто так, поэтому воспользуемся его мощностями:

share %>% 
  filter(trialtype != 'both') %>% 
  group_by(trialtype, setsize, platform, id) %>% 
  summarise(mean = mean(time1),
            median = median(time1),
            var = var(time1),
            sd = sd(time1),
            min = min(time1),
            max = max(time1),
            se = sd/sqrt(length(time1)),
            skew = moments::skewness(time1),
            kurt = moments::kurtosis(time1))
## `summarise()` regrouping output by 'trialtype', 'setsize', 'platform' (override with `.groups` argument)
## # A tibble: 216 x 13
## # Groups:   trialtype, setsize, platform [12]
##    trialtype setsize platform    id  mean median    var    sd   min   max     se
##    <chr>       <dbl> <chr>    <dbl> <dbl>  <dbl>  <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>  <dbl>
##  1 dots            8 android      4  1.37  1.16  0.342  0.585 0.750  3.40 0.0827
##  2 dots            8 android      6  1.20  0.945 0.669  0.818 0.667  5.92 0.116 
##  3 dots            8 android      7  1.86  1.77  0.325  0.570 0.809  3.15 0.0807
##  4 dots            8 android      8  1.85  1.59  0.578  0.760 1.03   4.53 0.108 
##  5 dots            8 android     10  1.04  0.964 0.0997 0.316 0.614  2.01 0.0447
##  6 dots            8 android     11  1.20  1.11  0.145  0.380 0.766  2.45 0.0538
##  7 dots            8 android     12  1.21  1.06  0.199  0.447 0.666  2.62 0.0632
##  8 dots            8 android     15  1.48  1.29  0.445  0.667 0.807  4.55 0.0943
##  9 dots            8 android     16  1.16  1.05  0.233  0.483 0.648  2.65 0.0683
## 10 dots            8 android     18  1.42  1.20  0.287  0.536 0.813  2.96 0.0758
## # … with 206 more rows, and 2 more variables: skew <dbl>, kurt <dbl>

Кода побольше, зато всё кастомное, а значит всем этим можно управлять! Обратите внимание, что для расчёта коэффициента асимметрии и коэффициента эксцесса потребуются функции из дополнительного пакета moments, который нужно установить через команду install.packages("moments").

Кучу описательных статистик мы насчитали. Теперь разберёмся в квартилями и выбросами (нехарактерными значениями). Когда мы с вами говорили о визуализации, мы упоминали, что график «ящик с усами» (boxplot) отображает выбросы. Посмотрим:

theme_set(theme_bw())
share %>%
  filter(trialtype != 'both') %>% 
  ggplot(aes(as_factor(setsize), time1, color = trialtype)) +
  geom_boxplot() +
  stat_summary(fun = mean, geom = 'point', shape = 15, position = position_dodge(0.8)) +
  facet_wrap(~ platform)

Видим много-много точек над ящиками — это и есть выбросы. Это данные поведенческого эксперимента, поэтому для последующего анализа мы желаем, чтобы таких значений в данных не было. Почистим!

share %>% 
  filter(trialtype != 'both') %>% 
  group_by(trialtype, setsize, platform, id) %>% 
  summarise(lower = quantile(time1)[2] - 1.5 * IQR(time1),
            upper = quantile(time1)[4] + 1.5 * IQR(time1)) %>% 
  right_join(share) %>% 
  filter(time1 > lower & time1 < upper) %>% 
  select(-lower, -upper) -> share_clear
## `summarise()` regrouping output by 'trialtype', 'setsize', 'platform' (override with `.groups` argument)
## Joining, by = c("trialtype", "setsize", "platform", "id")

Вот так мы удалили все выбросы. Можно было также воспользоваться функцией is_outlier(), которую мы написали в одном из заданий:

share %>% 
  filter(trialtype != 'both') %>% 
  group_by(trialtype, setsize, platform, id) %>% 
  mutate(outlier = is_outlier(time1)) %>% 
  filter(!outlier)
## # A tibble: 10,213 x 23
## # Groups:   trialtype, setsize, platform, id [216]
##    trialtype setsize time1 click1x click1y time2 click2x click2y    id platform
##    <chr>       <dbl> <dbl>   <dbl>   <dbl> <dbl>   <dbl>   <dbl> <dbl> <chr>   
##  1 tray            8  1.67    -227     202 1.28       14    -351     1 ios     
##  2 tray            8  1.13     -69     231 1.06      -44    -392     1 ios     
##  3 tray            8  1.59    -241      43 0.931     -25    -397     1 ios     
##  4 tray            8  1.14     -51      59 0.896      10    -383     1 ios     
##  5 tray            8  2.14      99      62 0.879     -29    -372     1 ios     
##  6 tray            8  1.63     213      46 0.947     -27    -353     1 ios     
##  7 tray            8  2.02     -70     -82 0.970     -19    -394     1 ios     
##  8 tray            8  1.08      72     -95 1.33       30    -399     1 ios     
##  9 tray            8  1.50     222     -55 0.879      46    -344     1 ios     
## 10 tray            8  1.36    -231    -229 0.880      -8    -388     1 ios     
## # … with 10,203 more rows, and 13 more variables: posx1 <dbl>, posy1 <dbl>,
## #   posxmin1 <dbl>, posxmax1 <dbl>, posymin1 <dbl>, posymax1 <dbl>,
## #   posx2 <dbl>, posy2 <dbl>, posxmin2 <dbl>, posxmax2 <dbl>, posymin2 <dbl>,
## #   posymax2 <dbl>, outlier <lgl>

Ну, вот теперь у нас мало того, что опрятные, так они еще и чистые!

Понравилась статья? Поделить с друзьями:
  • Стандартная ошибка оценки коэффициента регрессии формула
  • Стандартная ошибка точечной оценки
  • Стандартная ошибка регрессии это
  • Стандартная ошибка оценки коэффициента наклона
  • Стандартная ошибка точечного прогноза это